二期梅毒会引起虹膜睫状体炎、视网膜炎、脉络膜炎等多种眼疾病。常发作骨膜炎和关节炎。疼痛在晚间休息时加重，白天活动时则减轻。中枢神经系统损害，可以出现无症状的神经梅毒，检查脑脊液时有反常变化；极少数人有脑膜炎症状、颅神经麻痹等。二期梅毒患者的皮疹即使不经医治，也能在数周或2～3个月衰退。约1/4的病人症状衰退后可再复发，为二期复发梅毒，一般在感染后1～2年内发作，多发于免疫力低下的病人或医治用药剂量不足的病人。二期梅毒粘膜损害可单发，亦可与其他梅毒疹并发。在独自发作时易被忽略。吸烟、酗酒及经常吸取过热及刺激性食物者以及牙齿卫生差者易于发作或复发。二期期梅毒秃发部分存在梅毒螺旋体。而且梅毒螺旋体的部位与细胞浸润部位根本共同，所以认为梅毒性秃发可能与梅毒螺旋体的侵入部位有关。梅毒螺旋体不侵入毛乳头而侵犯毛囊的较上部，所以梅毒性秃发中以不完全秃发斑片为主。但是梅毒性脱发不是永久性脱发，如及时进行医治，头发可以在6~8周内再生，甚至不医治也可以再生。